深势科技合作开发的虚拟细胞模型ProteinTalks登上Nature,并推进药效预测落地
深势科技与合作团队在《Nature》发表虚拟细胞模型ProteinTalks,将大规模动态蛋白质组与神经常微分方程预训练结合,用于药物扰动响应预测。
推荐理由:深势科技作为论文合作方,梳理了ProteinTalks在单药筛选、联用与耐药机制上的实验验证路径。
深势科技与合作团队在《Nature》发表虚拟细胞模型ProteinTalks,将大规模动态蛋白质组与神经常微分方程预训练结合,用于药物扰动响应预测。
推荐理由:深势科技作为论文合作方,梳理了ProteinTalks在单药筛选、联用与耐药机制上的实验验证路径。
百奥几何宣布完成A+轮融资,A轮系列累计超1亿美元,本轮由国寿资本领投,老股东上海生物医药基金、达晨财智继续加码,国开科创、瑞力投资、国方创投及产业方跟投,指数资本担任独家财务顾问。
推荐理由:融资事件之外,材料还梳理了GeoFlow三代迭代与RSI干湿闭环的布局,并标注公司披露数据未经独立验证。
虚拟细胞药理学计划(VCPI)发布其迄今最大规模的数据集,为 ReFRAME 药物重定位化合物库提供阵列式 DRUG-seq 转录组图谱,覆盖 12,949 个化合物。数据在 THP-1 细胞中以 10 μM 剂量、每孔一个化合物进行筛选,注册用户可在 thevirtualcell.com 免费获取,并以 CC BY 4.0 开放。
推荐理由:该发布提供覆盖近1.3万临床阶段化合物的转录组扰动数据,可作为药物响应与虚拟细胞研究的公开数据资源。
Pathos AI 宣布与 Bristol Myers Squibb 和 Tempus AI 达成多年战略合作,为阿尔茨海默病及其他神经疾病构建专用数据集与智能体 AI 能力。
推荐理由:Pathos 与 BMS、Tempus 围绕神经疾病数据与 AI 平台达成合作,可观察 AI 平台如何介入临床开发决策。
NewLimit 在 2026 夏季进展中称,其首个重编程药物候选(LNP-RNA 递送重编程因子 RNA 至肝细胞)已完成放大生产工艺,单批产量超过 2025 年全年总和,制造规模较年初提升 314 倍、部分质量指标提升 13 倍,并在最相关非临床模型中观察到肝脏递送。
推荐理由:NewLimit 披露首个重编程药物候选的放大生产、动物递送与监管沟通进展,并给出载荷筛选与细胞年龄预测模型的具体提升幅度。
Valence Labs 提出 trajectory replay,一种面向 flow matching 和扩散模型等连续时间生成模型的持续学习技术,通过用前一模型生成路径的速度场重训模型来提醒其已学内容,全程不生成完整样本。
推荐理由:该方法用前一模型生成路径的速度场重训,避免生成完整样本,为连续时间生成模型的持续学习提供更省成本的替代方案。
英矽智能全球AI平台负责人Petrina Kamya在虚拟细胞论坛介绍了公司的虚拟衰老细胞模拟框架,该框架基于12年自有数据与基准测试构建,覆盖分子、细胞内、细胞间、组织/器官和机体五个生物学尺度。系统在每个生物层级使用约43个专用AI智能体,以患者种子基线图谱模拟干预后的细胞状态转变。Kamya表示,公司正在全自动机器人实验室中对机制未知的新分子开展前瞻性验证,以检验预测并排除对文献的记忆。
推荐理由:英矽智能公开虚拟衰老细胞框架的跨尺度多智能体架构,并说明其正用自动化实验室做前瞻验证。
insitro宣布与阿斯利康达成全球独家研究合作,针对MASH和心肌病发现新靶点与疗法,将获得4000万美元首付款,并有资格获得最高约14.6亿美元潜在发现、开发与商业里程碑付款及个位数分级销售提成。insitro将用其Virtual Human平台识别两个适应证的因果疾病生物学,并把阿斯利康提名的靶点推进至开发候选化合物,阿斯利康负责全部临床开发、监管与商业化。
推荐理由:交易把insitro的Virtual Human平台用于MASH与心肌病两个异质性适应证,并明确划分发现与临床分工。
英矽智能在2026年Pharma.AI秋季网络研讨会上发布MMAI Gym科学后训练与评估框架,并展示激酶活性、GPCR活性、ADMET预测、单步逆合成和治疗靶点发现五款专业模型,公司称其在70多项化学与生物学基准任务中达到或超越当前SOTA。
推荐理由:英矽智能一次性披露Pharma.AI秋季多项更新,含专业模型基准表现与逆合成对比数据,可作平台能力横向参照。
Turbine 宣布扩大与第一三共的合作,将其虚拟细胞平台用于 ADC 发现中的实验结果预测。Turbine 称该平台面向外部合作方使用,联合创始人兼 CEO Szabolcs Nagy 在相关帖子中说明哪些实验是真正的瓶颈。合作金额、具体资产与阶段未在正文披露。
推荐理由:Turbine 以虚拟细胞平台切入 ADC 实验预测,此次与第一三共扩大合作可作为观察平台外部可用性的样本。
Turbine宣布在第一三共完成可行性项目后扩大合作,其虚拟实验室vLab将支持第一三共的专有ADC项目,用Virtual Assays在载荷、联用、适应证和生物标志物决策上提供指导。Turbine称每个lab-in-the-loop循环都会把实验验证结果反馈进模型,在ADC发现中形成累积学习效应,双方将结合第一三共的数据与ADC经验加速新型癌症疗法发现。
推荐理由:该合作把虚拟实验室接入第一三共的ADC专有项目,并保留实验回馈模型的闭环,可作为ADC计算发现合作模式的参照。
Ginkgo 的虚拟细胞药理学计划 VCPI 宣布,现有及未来全部数据集在发布时即向所有注册用户开放,采用 CC BY 4.0 许可。三个版本合计覆盖超过 14,000 个化合物。
推荐理由:VCPI 将全部数据集即时开放给注册用户,为虚拟细胞药理学研究提供了可复用的数据入口。
EMBL-EBI 研究负责人 Julio Saez-Rodriguez 等人在一篇 Perspective 文章中讨论生物医学基础模型的基准评测,提出数据质量、模型仓库与评测框架三个相互关联的支柱,并主张将性能评估与方法开发隔离、由独立方在未见数据上评测。
推荐理由:EMBL-EBI 研究负责人系统梳理生物医学基础模型基准评测的三角框架与独立评测原则,为理解模型评测争议提供参照。
Valence Labs 的 Dominique Beaini 用可抢占 GPU 对 9,000 个靶点与 50 万配体运行 AlphaFold-Multimer 和 Boltz-2 共折叠及亲和力预测,累计 1 亿次,构建名为 affinity-prints 的数据集,并借助 Recursion 的表型组学图谱检验预测相互作用与细胞实验数据的对应关系。
推荐理由:作者用上亿次共折叠预测搭建亲和力指纹,并检验其与细胞表型数据的对应关系,为共折叠与虚拟细胞的衔接提供了一套可迁移的评测思路。
Biohub 与哥伦比亚大学等机构的研究者开发 AI 系统,用 ARACNe 与 VIPER/metaVIPER 从单细胞 RNA 测序数据中识别控制肿瘤细胞状态的 Master Regulators,发现同一瘤种的患者共享近乎相同的恶性细胞状态集合,相关结果发表于两篇 Nature Genetics 论文。
推荐理由:两篇 Nature Genetics 论文用单细胞数据刻画肿瘤细胞状态,并在 DMG 模型中验证组合用药的协同生存获益。
Valence Labs 发文认为,虚拟细胞最有价值的定位不是加速临床前流程,而是提升进入临床的候选质量,即做转化靶点验证。文章提出三个问题:靶点扰动是否在人类疾病生物学中产生预期效应、效应能否在患者生物变异中保持稳健、以及能否对疾病情境形成足够选择性;并建议在现有分子测量基准之外增加决策层评估,例如回溯识别后来因人类生物学不符预期而失败的假设。
推荐理由:Valence Labs 提出虚拟细胞应聚焦转化靶点验证,而非仅加速临床前流程,并给出可操作的评估维度。
Valence Labs 的 Inside Valence 文章梳理细胞表型组学从监督迁移学习走向自监督与生成式基础模型的路径,起点是 2019 年 Recursion 的 RxRx1 Kaggle 竞赛,该任务覆盖约 1,100 个 siRNA 条件、125,510 张图像,并在 50 多个实验批次中重复筛选。
推荐理由:梳理细胞表型组学从监督迁移学习到生成式基础模型的演进,并说明RxRx3数据集在虚拟细胞研究中的支撑作用。
NewLimit 在2026年5-6月进展更新中称,其先导重编程药物已完成生产放大超过120倍,足以支持关键非临床研究,并计划明年进入临床。其AI系统Ambrosia首次实现跨细胞类型泛化,在预测内皮细胞重编程效果时用少于三分之一的实验数据达到与谱系专用模型相当的性能。公司还发现5个可恢复衰老内皮细胞年轻基因表达与再生潜力的重编程载荷,并完成C轮融资。
推荐理由:NewLimit 披露先导资产放大生产与跨细胞类型泛化的进展,呈现重编程药物从发现走向临床前的具体路径。
Verge Labs 发布精准神经病学基础模型 vBx-1.0,称可从常规抽血重建患者脑分子状态,准确率最高为此前最先进模型的 3 倍。
推荐理由:该模型以脑组织转录组数据从血液重建脑分子状态,并在帕金森病与ALS试验数据上给出响应与耐受预测。
insitro 在第 86 届 ADA 科学年会上公布其 AI 发现的 MASH 候选 CTRO-1013(肝靶向 IRS1 siRNA)的临床前数据,显示在标准纤维化小鼠模型中肝靶向沉默 IRS1 使 TIMP-1 降低 37%、CK-18 降低 68%(16 周,1 mg/kg,每 4 周一次),且抗纤维化信号部分独立于肝脏脂肪下降。
推荐理由:该材料披露 IRS1 靶点从人类遗传学发现到 siRNA 候选物的临床前数据链,可观察 AI 表型与遗传证据如何衔接管线推进。