预印本指扰动预测评测漏洞并提出CORE

Xinyu Yuan、Xixian Liu 等人的预印本《Plausibility Is Not Prediction》检验细胞扰动二分类差异表达预测，指出忽略扰动身份的 Gene-prior Voting 基线在 C32 黑色素瘤任务总体 AUROC 仍达 0.990，但改用同基因内比较扰动的 macro-per-gene 评测后，该基线 AUROC 只有 0.500。 该预印本据此提出 CORE 评测方法，要求测试扰动与已知支持样本中的扰动分开。在 CRISPRi 扰动的 K562 任务中，投票版把分基因 AUROC 从 0.500 提到 0.711；四个 PerturbQA 细胞系的平均值约为 0.703。C32 的语言模型对照统一使用 50 种支持扰动、每种最多 200 个已知基因标签，共 10,000 对支持样本；C32 正例需同时满足校正后 p 值小于 0.05、绝对 log-fold change 大于 0.25。

AI 根据报道生成 · 13 天前更新