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DUET:仅用序列预测RNA-小分子结合位点

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AI 综述

Xiong、Jia等人提出仅依赖序列的RNA-小分子结合位点预测方法DUET,将关系图模块与两个基于冻结RNA语言模型的卷积序列模块结合。在去除与规范测试链达80%同源性的98条训练和验证记录、保留110条序列相同记录并划分115个同源组后,作者报告在10组配对随机种子下DUET的MCC为0.240±0.013,高于同一数据上CoBRA-M3的0.192±0.031(差值+0.047,Holm p=0.0073),AUC和AUPRC也同步提升。 不过,DUET与GRASSP在外部数据集上差异不显著(MCC 0.246对0.243)。作者还称,将训练集从80条增至290条可使DUET的MCC提高0.135。上述比较均为该研究自行评测的结果。

AI 根据报道生成 · 9 天前更新

报道时间线

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10月30日
  1. bioRxiv · Bioinformatics精选
    DUET:仅用序列预测RNA-小分子结合位点

    DUET是一种仅依赖序列的RNA-小分子结合位点预测方法,结合关系图模块与基于冻结RNA语言模型的两个卷积序列模块。

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