BindCraft2与RFD4-Proteina杀虫靶点多肽设计对比

一项预印本研究在三个杀虫剂靶点上比较了 BindCraft2 与 RFD4-Proteina 的从头多肽结合剂设计能力。三个靶点分别是乙酰胆碱酯酶（PDB 1QON，540 个残基）、蜕皮激素受体配体结合域（1R1K，236 个残基）和兰尼碱受体 SPRY2 域（6KIM，169 个残基）；所有设计都用同一个 AlphaFold2 oracle 重新折叠检验。 结果显示，RFD4 在 3.3 GPU 小时内返回 300 个设计，其中 82 个通过共同的重新折叠筛选；BindCraft2 在 58.7 GPU 小时内只返回 10 个设计，其中两个靶点没有产出任何设计，10 个中有 3 个通过同一筛选。 在较大的两个靶点上，RFD4 生成的复合物坐标看起来已结合，但未能通过重新折叠；BindCraft2 则没有接受任何设计。

AI 根据报道生成 · 2 天前更新