斯坦福等机构发布蛋白设计框架 ProteoCraft

斯坦福大学 X-lab、SNAP 实验室与香港科技大学（广州）等机构在 arXiv 预印本中提出蛋白设计框架 ProteoCraft，把设计拆成近似梯度提议与 ESMFold2 完整结构预测复核，再用蒙特卡洛树搜索分配预测预算，支持结合蛋白从头设计和限定区域局部改造。 在计算基准中，该框架在独立 AF2-IG 评估下的严格通过率为 86.2%，但同一评估的平均 iPTM 仅 0.282，虽高于对照，绝对值仍不高。在 PD-L1 微型蛋白湿实验中，团队从计算流程筛出 35 个候选，全部达到表达与检测上样要求，其中 29 个测得结合；6 个候选的报告所选拟合 Kd 低于 10 nM，最佳单次 SPR 拟合 Kd 为 0.879 nM，原文注明该值来自单次测量，并非多轮独立重复确认。 团队称下一步将通过细胞层面功能实验，检验候选能否按预期影响免疫信号和细胞反应，并将结果反馈到后续设计。

AI 根据报道生成 · 9 小时前更新