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ThermoMPNN提升单突变稳定性预测精度

1 篇报道1 个报道来源15 天前更新

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AI 综述

北卡罗来纳大学教堂山分校Brian Kuhlman团队在PNAS发表论文,提出将ProteinMPNN结构特征迁移到稳定性预测任务的ThermoMPNN模型。该模型在大规模稳定性测试集上预测值与实验值的相关系数约0.75,高于直接使用ProteinMPNN的约0.43;在排除同源蛋白的传统实验数据上约0.65,高于后者的约0.41。 在排除同源蛋白的数据集中,以−0.5 kcal/mol为增稳阈值,模型预测增稳的61个突变中有34个符合实验标准,命中率约56%。论文的单张显卡测试条件下,扫描一个693个残基蛋白质的全部单点替换约需8秒。

AI 根据报道生成 · 14 天前更新

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沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月25日
  1. BioAICraft精选
    PNAS论文提出ThermoMPNN单突变稳定性打分器

    北卡罗来纳大学教堂山分校Brian Kuhlman团队在PNAS发表论文,提出将ProteinMPNN结构特征迁移到稳定性预测任务的ThermoMPNN模型。该模型在Megascale测试集上预测值与实验值的相关系数约0.75,在Fireprot无同源子集上约0.65,均高于直接使用ProteinMPNN的约0.43和0.41。