BioAIDesign 发布结构评估指南并实操 foldmetrics 0.2.2
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BioAIDesign 发布结构评估指南并实操 foldmetrics 0.2.2
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AI 综述
BioAIDesign(作者 JoeYo)发布结构预测评估指南,逐层解释 pLDDT、PAE、pTM、ipTM、pDockQ、pDockQ2、ipSAE 与 LIS 等指标各自回答局部可信度、链间相对位置还是与参考结构的准确度,并指出 ipTM 0.9 不能换算成亲和力。文章同时实操演示 foldmetrics 0.2.2 将分散的预测结果汇总成表格和图。 使用条件方面,项目声明 Python 需为 3.10 或以上,文章在 Python 3.11 独立环境实测该版本;当前主要验证场景是蛋白链对,小分子相关的 legacy ipSAE/LIS token 评分仍属实验性支持,ipSAE2 的新增分子规则需按版本单独说明。作者称此次没有重新运行五种结构预测器,也没有用五个样本评测谁更准确。
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最新进展11月5日 08:35
BioAIDesign 解析 pLDDT、ipTM 等结构预测评估指标并实操 foldmetrics报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月5日
- BioAIDesign精选BioAIDesign 解析 pLDDT、ipTM 等结构预测评估指标并实操 foldmetrics
BioAIDesign 发布结构预测评估指南,逐层解释 pLDDT、PAE、pTM、ipTM、pDockQ、pDockQ2、ipSAE 与 LIS 等指标分别回答局部可信度、链间相对位置还是与参考结构的准确度,并指出 ipTM 0.9 不能换算成亲和力。
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