Geodesic 发布 NovaAtom-Lite 并公布多项基准成绩
先了解这件事
顾全全创立的 Geodesic Intelligence 于 2026 年 11 月 10 日发布全原子结构预测模型 NovaAtom-Lite，可预测蛋白质、核酸及其结合分子的结构，并通过 Geodesic API 与 NovaDDE 平台提供云端调用。 发布方称，在 FoldBench 抗体–抗原任务（DockQ ≥ 0.23）的 172 个界面上成功率 79.07%，高于 IsoDDE 公布值 75.58% 和 AlphaFold 3 的 47.90%（167 个界面）；蛋白–配体成功率 77.06%，成功需配体 RMSD < 2 Å 且 LDDT-PLI > 0.8。发布方另称在 PXMeter 的 PXM-22to25-AB 集（528 个 PDB 条目、383 个聚类）上成功率 66.05%，高于 OpenDDE 的 51.0%；在自建 Runs N' Poses 蛋白–配体基准的八个相似度分组中均领先，最不相似组（n=63）为 47.6% 对 AlphaFold 3 的 23.8%。机器之心报道称，NovaAtom-Lite 在 FoldBench 八项任务中三项第一、七项进入前三。 这些比较均为发布方自述，尚无独立验证；NovaAtom-Lite 对每个目标用 5 个随机种子各采样 5 个结构、由模型自身分数选出一个结果，其他模型数字来自不同公开评测、部分样本数不同，公司也提示一两个百分点的差距应谨慎看待。Geodesic 公布的结果中，普通蛋白–蛋白界面和蛋白–RNA 界面等均有其他模型取得更高分数。模型训练数据截止 2021 年 9 月 30 日，规模与权重开放情况未披露。上述成绩为回顾性结构预测表现，并非新设计抗体的湿实验命中率。免费版每周 100 积分，Plus 每月 30 美元、每周 1000 积分，具体消耗取决于模型和输入规模。
AI 根据报道生成 · 5 小时前更新
事件进展
4 个进展
- 11月11日 02:00 · 1 篇报道Geodesic公布Runs N' Poses蛋白-配体结构评测Geodesic Intelligence：Geodesic Intelligence 发布 Runs N' Poses 评测：NovaAtom-Lite 在陌生样本上领先 AlphaFold 3
- 11月11日 02:00 · 1 篇报道NovaAtom-Lite在PXM-22to25-AB抗体抗原集评测领先Geodesic Intelligence：Geodesic Intelligence 在 PXMeter 抗体-抗原集上评测 NovaAtom-Lite，成功率 66.05%
- 11月11日 02:00 · 2 篇报道NovaAtom-Lite 对抗体-抗原复合物 8IDO 的结构预测Geodesic Intelligence：Geodesic Intelligence 发布 NovaAtom-Lite，FoldBench 抗体抗原与蛋白配体预测优于 IsoDDE 和 AlphaFold 3
- 11月11日 02:00 · 7 篇报道NovaAtom-Lite 全原子结构预测模型发布Geodesic Intelligence：Geodesic Intelligence 发布全原子结构预测模型 NovaAtom-Lite
报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
- 机器之心 · AI4ScienceGeodesic Intelligence 发布全原子结构预测模型 NovaAtom-Lite，抗体-抗原界面成功率 79.07%
顾全全创立的 Geodesic Intelligence 发布 NovaAtom 家族首个模型 NovaAtom-Lite，可对蛋白质、DNA、RNA 及结合小分子进行全原子结构预测。
- 下一分子AI制药日报｜NovaAtom-Lite、Mol-1-constraint与AlphaGenome 2等模型密集发布
Geodesic Intelligence发布全原子结构预测模型NovaAtom-Lite并通过API与NovaDDE平台提供使用，Molence Bio推出可输入SITE、CONTACT、EXCLUSION三类结合线索的Mol-1-constraint。
- 下一分子精选Geodesic 发布全原子结构预测模型 NovaAtom-Lite 并公布界面基准
顾全全创立的 Geodesic Intelligence 于 2026 年 11 月 10 日发布全原子结构预测模型 NovaAtom-Lite，通过 API 和 NovaDDE 平台提供使用。
- BioAIDesignGeodesic Intelligence发布NovaAtom-Lite结构预测模型与NovaDDE科研Agent
Geodesic Intelligence发布结构预测模型NovaAtom-Lite，在FoldBench的172个抗体—抗原界面上以DockQ≥0.23为成功标准取得79.07%成功率，高于AlphaFold 3和IsoDDE，并开放云端调用入口。
- BioTenderGeodesic Intelligence发布全原子结构预测模型NovaAtom-Lite，抗体—抗原成功率79.07%
顾全全创立的Geodesic Intelligence于2026年11月10日发布全原子结构预测模型NovaAtom-Lite，官方公布FoldBench抗体—抗原成功率79.07%、蛋白—配体77.06%。
- 澪乃ゆいGeodesic Lab 发布 NovaAtom-Lite 全原子结构预测模型
Geodesic Lab 发布 NovaAtom-Lite，用于蛋白质、核酸及其结合分子的全原子结构预测。推文仅给出模型名称、覆盖对象和官网链接，未披露模型规模、权重开放情况或评测结果。
- 澪乃ゆいGeodesic Lab 发布全原子结构预测模型 NovaAtom-Lite
Geodesic Lab 发布全原子结构预测模型 NovaAtom-Lite，可预测蛋白质、核酸、小分子及其复合物的全重原子坐标。作者转述称，FoldBench 上抗体–抗原预测成功率 79.1%、蛋白质–配体 77.1%，在所列比较中均高于 AlphaFold 3 与 IsoDDE；抗体–抗原一项原文给出 DockQ ≥ 0.23 口径下 79.07%（n=172），对比 IsoDDE 75.58%、AlphaFold 3 47.90%（n=167），评测采用 5 seeds × 5 samples 并按模型自身排序分数取 top-1。模型已通过 Geodesic API 与 NovaDDE 提供。
- Geodesic Intelligence精选Geodesic Intelligence 发布 Runs N' Poses 评测：NovaAtom-Lite 在陌生样本上领先 AlphaFold 3
Geodesic Intelligence 发布 Runs N' Poses 基准，按与训练数据的相似度分组评测蛋白-配体结构预测，其模型 NovaAtom-Lite 在全部八组中领先。
- Geodesic Intelligence精选Geodesic Intelligence 在 PXMeter 抗体-抗原集上评测 NovaAtom-Lite，成功率 66.05%
Geodesic Intelligence 在 PXMeter 的 PXM-22to25-AB 抗体-抗原集上测试 NovaAtom-Lite，以 DockQ ≥ 0.23 为成功标准，成功率为 66.05%（528 个 PDB 条目、383 个聚类）。
- Geodesic Intelligence精选Geodesic Intelligence 发布 NovaAtom-Lite，FoldBench 抗体抗原与蛋白配体预测优于 IsoDDE 和 AlphaFold 3
Geodesic Intelligence 发布结构预测模型 NovaAtom-Lite，称其在 FoldBench 的抗体抗原任务上成功率为 79.07%（n=172），高于 IsoDDE 的 75.58% 和 AlphaFold 3 的 47.90%（n=167）。
- Geodesic IntelligenceNovaAtom-Lite 预测抗体抗原结合界面
为什么关注抗体–抗原？ 抗体是一类重要的治疗药物。了解它们在哪里以及如何结合靶点，有助于指导其设计。 把这一界面预测准确是结构预测中最棘手的挑战之一：结合环（CDR）具有柔性，且可用的共进化信号很少。 以下是 NovaAtom-Lite 对 8IDO 的预测（彩色），叠加在实验结构（灰色）上。DockQ：0.839。
- Geodesic Intelligence精选Geodesic Intelligence 发布全原子结构预测模型 NovaAtom-Lite
Geodesic Intelligence 发布面向药物发现的全原子结构预测模型 NovaAtom-Lite，可预测蛋白质、核酸及其结合分子的结构以及它们的结合方式。
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