DiffTernary分子胶三元复合物对接模型与数据集

Liao Y. 等作者发布预印本，提出扩散对接模型 DiffTernary，可同时预测分子胶三元复合物中蛋白的相对排布和分子胶的结合构象，并构建了含 76,702 个实验解析三元复合物的 Ternary-PDB 数据集。 作者称，在该数据集上训练后，DiffTernary 对 50.0% 的 MGBench 复合物单次预测达到可接受的蛋白-蛋白相互作用预测（DockQ > 0.23），AF3 为 51.1%；在 25 次预测中取最优时，DiffTernary 的成功率为 78.4%，低于 ESMFold2 的 90.9%，高于 AF3 的 72.7%。另有一个在 TernaryDB 上训练的 DiffTernary 模型，在 TernaryDB MGD 测试集 94 个复合物上单次预测的平均 DockQ 为 0.306，DeepTernary 为 0.228；从 40 个样本中按置信度筛选后，DiffTernary 对 41.5% 的复合物给出可接受的 PPI 预测，DeepTernary 为 30.9%。 这些数字均为作者在预印本中的报告，尚未经过同行评审。

AI 根据报道生成 · 2 天前更新