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Atom14 与 Atom37:蛋白质设计模型如何记录原子

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AI 综述

Oxford Protein Informatics Group 的一篇博客文章解释,蛋白质设计模型用固定张量记录原子坐标,主要有 Atom14 和 Atom37 两种布局:前者为每个残基保留 14 个原子槽位,后者保留 37 个。文章比较了 RFdiffusion3、BoltzGen 和 La-Proteina 在序列未知的从头设计中如何处理这些槽位。 据该文,RFdiffusion3 为每个残基保留 14 个点,用虚拟原子填充未使用的槽位并统一去噪,序列随后由 ProteinMPNN 或 LigandMPNN 设计。

AI 根据报道生成 · 11 天前更新

报道时间线

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10月29日
  1. Oxford Protein Informatics Group · Blog
    Atom14 与 Atom37:蛋白质设计模型如何记录原子

    文章解释 Atom14 与 Atom37 两种将蛋白质原子坐标压入固定张量的布局,并比较 RFdiffusion3、BoltzGen 和 La-Proteina 在序列未知的从头设计中如何处理原子槽位。RFdiffusion3 为每个残基保留 14 个点,用虚拟原子填充未用槽位并统一去噪,序列随后由 ProteinMPNN 或 LigandMPNN 设计。

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