Baker团队设计蛋白探针识别Tau/Aβ修饰
先了解这件事
华盛顿大学蛋白质设计研究所 Kejia Wu、David Baker 等与麻省总医院等团队在 bioRxiv 发布预印本，通过从头设计获得能识别 Tau 和 Aβ 特定化学修饰、并区分 Tau 邻近磷酸化组合的蛋白探针。后续报道称，该工作用 Logos 生成未修饰肽段结合界面，再以 RFD3、RFD4 生成磷酸丝氨酸、磷酸苏氨酸和焦谷氨酸化学口袋，经 ProteinMPNN 与 AlphaFold 3 筛选，得到识别 Tau pT217、pT231、pS202/pT205/pS208 及 N3pG-Aβ 的基因编码蛋白读取器。 四类靶标共测试 768 个候选，其中 51 个能选择性识别修饰靶标，命中率约 6.6%；该比例只统计进入实验的候选，各方案投入的总生成预算并不相同。pT231 探针对磷酸化肽响应明显、对谷氨酸替换肽响应很弱。 探针的选择性仍有交叉：pT217 探针对 α-突触核蛋白 pS129 有响应，Aβ 探针也能结合促性腺激素释放激素。
AI 根据报道生成 · 11 天前更新
报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
- AI-Protein DesignAI蛋白质设计在神经退行性疾病领域的进展如何？
针对阿尔茨海默病、ALS等神经退行性疾病，现有7项AI蛋白质设计研究覆盖金属蛋白酶降解Aβ与TDP43、靶向FUS/Amylin/Aβ/Tau/TDP43的binder设计及病理修饰检测，多数由David Baker团队完成。金属蛋白酶研究仅完成体外实验，细胞与动物验证仍是挑战；靶向无序蛋白的binder设计曾尝试polyQ但失败。整体研究数量不多，尚无AI设计蛋白药物进入AD治疗。
- AI-Protein DesignBaker团队用RFD3/RFD4设计蛋白读取器，识别阿尔茨海默病Tau与Aβ病理修饰
华盛顿大学David Baker团队联合哈佛医学院等机构在bioRxiv报告，用Logos生成未修饰肽段结合界面、再以RFD3与RFD4生成磷酸丝氨酸、磷酸苏氨酸和焦谷氨酸化学口袋，经ProteinMPNN与AlphaFold 3筛选，从头设计出识别Tau pT217、pT231、pS202/pT205/pS208及N3pG-Aβ的基因编码蛋白读取器。
- BioAICraft精选Baker 团队设计无序区蛋白探针识别 Tau 与 Aβ 修饰并区分邻近磷酸化组合
华盛顿大学蛋白质设计研究所 Kejia Wu、David Baker 等与麻省总医院等团队在 bioRxiv 发布预印本，通过从头设计获得识别 Tau 和 Aβ 特定化学修饰的蛋白探针。
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