纽约基因组中心团队在Cell提出RNA指纹分析框架
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纽约基因组中心团队在Cell提出RNA指纹分析框架
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纽约基因组中心的Rahul Satija和David A. Knowles团队在Cell发表RNA指纹分析统计框架,以大规模单细胞扰动数据为参考库,从单细胞转录组状态反推可能驱动该状态的基因、药物或细胞因子。 据该团队报告,在同一种细胞中,模型成功匹配的细胞里有88%的最高可信集包含真实扰动;将同一条件的多个细胞合并分析后,准确率进一步达到95%。跨细胞类型分析时准确度有所下降,但成功匹配的细胞中仍有81%包含正确扰动。 该框架仍依赖参考数据是否完整,也更适合分析相对线性的扰动效应。
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最新进展11月9日 17:06
纽约基因组中心团队在Cell提出RNA指纹分析框架,从单细胞转录组反推细胞扰动报道时间线
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11月9日
- BioArt精选纽约基因组中心团队在Cell提出RNA指纹分析框架,从单细胞转录组反推细胞扰动
纽约基因组中心的Rahul Satija和David A. Knowles团队在Cell发表RNA指纹分析(RNA fingerprinting)统计框架,以大规模单细胞扰动数据为参考库,从单细胞转录组状态反推可能驱动该状态的基因、药物或细胞因子。
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