CK2α′选择性抑制剂基准：对接评分与实测选择性不相关

一项预印本基准研究用140个化合物对CK2α与CK2α′两个亚型的配对实测数据，检验标准结构导向流程能否设计并排序CK2α′偏好性化合物。作者Tarun称，GNINA对接与卷积神经网络重打分得到的五项计算指标均与实测选择性不相关（ρ = −0.19 至 +0.12），对仅差一个连接亚甲基的配对化合物还出现排序反转。 研究将原因归于两个亚型分子动力学系综高度重叠（亚型间0.88 Å，亚型内0.72–0.96 Å），认为选择性信号低于方法的分辨能力。化合物EV043的端点自由能对CK2α′偏好最大（ΔΔGb −7.74 kcal/mol），但该值对CK2α中的起始构象敏感。 结论是：在这批化合物上，标准对接与重打分流程无法可靠区分CK2α′偏好性，结构导向设计亚型选择性抑制剂存在局限。

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