他汀类似物与HMGCR对接及分子动力学模拟预印本

Towle、Tyrell 等人在 ChemRxiv 发表预印本，用集合对接和重复分子动力学模拟研究 13 种他汀相关分子状态与人 HMGCR 的相互作用。作者将 13 种状态分别对接到 6 个配体结合 HMGCR 晶体结构，每个组合独立搜索 3 次，共 234 次；再对其中 8 种状态各做 3 条独立 50 ns 模拟，共 24 条轨迹、1.2 μs。 结果显示，不同受体结构下，排名最高的、与基序兼容的构象回收率差异较大：1HW8 为 15/39，1HWK 为 38/39。G3-001 的两种立体异构体与 Glu559 的几何氢键占据率差异明显：A(R) 的中位数为 8.2%，B(S) 为 91.0%，且 B 在 3 组配对重复中均更高；G3-005 的醚链延伸在一条重复中出现明显外周位移。 作者称，这些计算观察提示受体构象、配体立体化学与相互作用持续性之间存在可检验的关系，并未给出实验验证的活性结论。

AI 根据报道生成 · 5 天前更新