LingoCell单细胞与空间转录组基础模型发布
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LingoCell单细胞与空间转录组基础模型发布
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AI 综述
Yang, Y. 等作者在 bioRxiv 预印本中提出 LingoCell，一个连接单细胞与空间转录组的基础模型。该模型将细胞表征与自然语言对齐，同时保持基因表达可编辑，支持细胞注释、跨批次整合、描述生成，以及单基因和组合的计算扰动疾病语言读出。 扩展到组织层面后，LingoCell 可在没有单细胞参考数据的情况下注释细胞，学习以细胞身份为条件的微环境嵌入，并通过替换和编辑邻近细胞表达进行空间计算扰动。作者称，在肺腺癌中，该模型揭示了同时削弱肺泡分化程序与增强恶性程序所产生的协同疾病响应；在结直肠癌中，它揭示了同一成纤维细胞状态向 T 细胞、巨噬细胞和肿瘤细胞传递的不同程序。
AI 根据报道生成 · 3 天前更新
最新进展11月10日 08:00
LingoCell 用自然语言与组织微环境解读基因扰动报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
11月10日
- bioRxiv · Bioinformatics精选LingoCell 用自然语言与组织微环境解读基因扰动
LingoCell 是一个连接单细胞与空间转录组的基础模型，将细胞表征与语言对齐并保持基因表达可编辑，支持细胞注释、跨批次整合、描述生成以及单基因和组合的计算扰动疾病语言读出。
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