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WhatRes评估AI预测蛋白结构真实性

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AI 综述

van der Kant等作者在预印本中提出结构评估工具WhatRes,从坐标出发,用“表观分辨率”和“真实性”两个维度衡量AI预测的蛋白结构与实验结构的几何差异。表观分辨率估计局部几何最接近的实验分辨率;真实性衡量该几何与同分辨率实验结构的吻合程度。 作者称,预测模型可在表观分辨率上得分良好,但键长和键角的变异系统性小于高分辨率晶体结构所观察到的水平,这种过度理想化在高置信模型中同样存在。该工作以预印本摘要形式报告。

AI 根据报道生成 · 4 天前更新

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11月9日
  1. bioRxiv · Bioinformatics精选
    WhatRes:评估AI预测蛋白结构与实验结构的几何差异

    作者提出WhatRes,从坐标出发在表观分辨率和真实性两个维度评估蛋白结构,前者估计局部几何最接近的实验分辨率,后者衡量该几何与同分辨率实验结构的吻合程度。作者指出预测模型可在表观分辨率上得分良好,但键长和键角的变异系统性小于高分辨率晶体结构,这种过度理想化在高置信模型中同样存在。该工作为预印本摘要报告。

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