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ANTIOCH-VS 开源虚拟筛选框架预印本发布

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AI 综述

马里兰大学 Hale S. Hasdemir 等发布预印本,提出开源集成虚拟筛选框架 ANTIOCH-VS:从蛋白序列出发,经构象系综构建、对接与共识排序,输出候选结合剂短名单,无需配体结合晶体或人工干预。 在 JAK2 激酶和 ADRB2 GPCR 的 DUD-E 基准上,仅用序列生成的 AF2RAVE 系综使 top-20 短名单命中率达 20% 和 60%(随机约 1–2%),作者称与配体结合晶体结构相当,JAK2 上还高于单一 AF2 模型和 apo 晶体。 框架可单命令在工作站或 HPC 上端到端运行,各模块也可单独使用;作者称其可免费获取。

AI 根据报道生成 · 2 天前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

11月11日
  1. arXiv · q-bio.BM (生物大分子)精选
    ANTIOCH-VS:从序列到命中化合物的模块化开源集成虚拟筛选框架

    马里兰大学团队提出开源框架 ANTIOCH-VS,可从蛋白序列出发完成构象系综构建、对接与共识排序,输出候选结合剂短名单。在 JAK2 激酶和 ADRB2 GPCR 的 DUD-E 基准上,仅用序列生成的 AF2RAVE 系综使 top-20 短名单命中率达 20% 和 60%(随机约 1-2%),与配体结合晶体结构相当,JAK2 上还高于单一 AF2 模型和 apo 晶体。

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1011月11日 14:00
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