Baker Lab发布AI设计合成转录激活子预印本
先了解这件事
华盛顿大学蛋白质设计研究所（IPD）与Rice大学Isaac Hilton组于2026年10月20日在bioRxiv发布预印本，用AlphaFold3绘制转录激活结构域与辅因子的界面地图，再以RFdiffusion和ProteinMPNN从头设计65—85个氨基酸的小蛋白binder，接到dCas9上招募细胞原有的转录共激活因子，在人类细胞中激活基因。 哺乳动物池筛获得超过300个针对Mediator多亚基、BRD4、NCOA、p300的nM级binder；挑出的34个结合蛋白全部通过报告基因激活验证。在HEK293T细胞的CD34实验中，12个p300结合蛋白有11个带来比传统激活模块VPR更高的阳性细胞比例。报告基因读出拟合呈超灵敏曲线，文内称过渡约500 nM；MED25-KO细胞中MED25 binder激活消失，MED15 binder与VP64仍在。 研究尚未经同行评议，验证仍停在细胞报告与内源座位，临床与体内回路是下一程；基因抑制仍是后续设想。
AI 根据报道生成 · 7 天前更新
报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
- AI-Protein Design精选bioRxiv 预印本：从头设计微型效应因子，体积缩小约90%并提升 CRISPRa 效率
2026年10月发表于 bioRxiv 的研究提出用 AlphaFold3 映射转录激活结构域与共激活因子的相互作用界面，再经 RFdiffusion 与 ProteinMPNN 从头设计结合蛋白，构建约4万种设计的候选文库。
- 下一分子AI制药月报｜2026年10月：蛋白质设计转向功能验证，虚拟细胞数据规模扩大
下一分子10月月报收录33项进展，蛋白质设计重点从生成候选延伸至功能验证，虚拟细胞数据规模继续扩大，产业合作聚焦递送与蛋白疗法。月报以时间线梳理Baker Lab及IPD的14项研究，涵盖模型工具、功能设计与可开发性。其他进展包括RFdiffusion3正式发表、RFD4开源，以及剂泰与礼来就LNP递送达成合作，首付款逾千万美元、里程碑最高11亿美元。
- Kevin K. Yang用深度学习设计招募辅激活因子的蛋白
转录因子利用弱相互作用招募转录辅激活因子，这使得进行合成、精确的转录调控变得困难。相反，用深度学习来设计高亲和力的辅激活因子招募蛋白！ @wchenomics @ruopu22 @kinasekid @isaacbhilton
- BioTender精选Baker团队预印本：AI设计小蛋白接管人类细胞基因开关
David Baker与Isaac Hilton等人在2026年10月20日发布bioRxiv预印本，用AI设计65—85个氨基酸的小蛋白，接到dCas9上招募细胞原有转录共激活因子，在人类细胞中激活基因。
- LeapFun精选Baker Lab用AF3与RFdiffusion设计65-85 aa合成转录激活子
华盛顿大学IPD与Rice大学团队在bioRxiv发布预印本，用AlphaFold3绘制TAD-辅因子界面地图、RFdiffusion与ProteinMPNN生成结构化binder，经哺乳动物功能池筛获得超过300个针对Mediator、BRD4、NCOA、p300的nM级binder。
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