Baker团队发布MINT:保留蛋白功能并降低CD8⁺T细胞免疫原性
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Baker团队发布MINT:保留蛋白功能并降低CD8⁺T细胞免疫原性
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AI 综述
David Baker、Nir Hacohen等人在bioRxiv发布预印本,提出MINT计算框架,目标是在保留蛋白质功能的同时降低CD8⁺T细胞免疫原性。该框架将ProteinMPNN序列生成与NetMHCpan4.1表位预测结合,以从头设计的荧光素酶LuxSit-i为模型蛋白:固定底物附近43个残基以维持催化活性,仅改造其余74个残基。 小鼠免疫实验中,5个低表位设计诱导的CD8⁺T细胞反应接近背景,5个高表位设计则引起明显反应。计算优化扩展到25种常见人类HLA-I等位基因后,候选蛋白的预测强表位计数降至零;但人类HLA优化产物主要通过表位预测与结构预测评估,尚未报告实验验证。 该工作为预印本,结论有待同行评议。
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最新进展10月31日 20:01
Baker团队在bioRxiv发布MINT算法,设计出低免疫原性且保留活性的荧光素酶报道时间线
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11月6日
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斯坦福团队 ProVADA 模型作者在 bioRxiv 预印本基础上撰文,对比自家 ProVADA 与 David Baker 团队 MINT、普林斯顿团队 MESSI 三条生成式 AI 去免疫原性路线。
10月31日
- AI-Protein Design精选Baker团队在bioRxiv发布MINT算法,设计出低免疫原性且保留活性的荧光素酶
Baker团队在bioRxiv预印本中提出MINT计算框架,将ProteinMPNN序列生成与NetMHCpan4.1表位预测结合,以从头设计的荧光素酶LuxSit-i为模型蛋白,在固定43个底物附近残基、仅改造其余74个残基的条件下保留催化活性并清除表位。
10月29日
- BioAICraft精选David Baker团队发布MINT方法:在保留蛋白功能的同时降低CD8⁺ T细胞免疫原性
David Baker、Nir Hacohen等人在bioRxiv发布预印本,提出MINT方法,在保留蛋白质功能的前提下降低CD8⁺ T细胞免疫原性。
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