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ResiDPO微调LigandMPNN提出EnhancedMPNN

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AI 综述

悉尼科技大学、华盛顿大学、伊利诺伊大学厄巴纳—香槟分校和浙江大学的研究者在arXiv发布论文,提出残基级可设计性偏好优化方法ResiDPO,并用它微调LigandMPNN,得到蛋白质序列设计模型EnhancedMPNN。 论文报告的计算测试显示:在五类酶的设计测试中,序列的计算筛选通过率从6.56%提高到17.57%;在五个蛋白质靶标的结合物设计中,序列通过率从7.07%提高到16.07%。使用约一千个骨架训练的ResiDPO,在偏好学习评价指标上达到使用约一万九千个骨架训练的普通DPO的相近水平。 这些通过率均为计算筛选结果;论文称后续实验表征可进一步检验候选在表达、折叠及目标功能上的表现。

AI 根据报道生成 · 11 天前更新

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10月28日
  1. BioAICraft精选
    arXiv论文提出ResiDPO并微调LigandMPNN得到EnhancedMPNN

    悉尼科技大学、华盛顿大学、伊利诺伊大学厄巴纳—香槟分校和浙江大学研究者在arXiv发布论文,提出残基级可设计性偏好优化方法ResiDPO,用它微调LigandMPNN得到EnhancedMPNN。

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