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MeCoBi开源工具可从SMILES构建金属配合物3D结构

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AI 综述

Gustavo Clauss等人发布开源工具 MeCoBi,可从配体 SMILES 自动构建并优化单核金属配合物的三维结构,覆盖 36 种 d 区及主族金属、配位数 2–9,并提供网页界面 mecobi.york.ac.uk。 在剑桥结构数据库 30,830 个实验结构上,MeCoBi 为 99.6% 的配合物生成了结构,金属–配体键长误差中位数为 0.06 Å。作者称,在其实验室制备的 1,800 个铱配合物抗菌活性数据上,MeCoBi 对新配合物的排序优于二维描述符模型(ROC-AUC 0.88 对 0.84),且仅用 SMILES 构建的结构仍保持这一提升。

AI 根据报道生成 · 3 天前更新

报道时间线

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11月10日
  1. ChemRxiv Preprints精选
    MeCoBi:从配体 SMILES 批量构建过渡金属配合物三维结构的开源工具

    MeCoBi 是一个自动化流程,可从配体 SMILES 构建并优化单核金属配合物的三维结构,覆盖 36 种 d 区及主族金属、配位数 2–9。在剑桥结构数据库 30,830 个实验结构上,它为 99.6% 的配合物生成了结构,金属–配体键长误差中位数为 0.06 Å。

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