尼帕病毒泛蛋白组多表位疫苗候选计算设计

Nishan等作者在bioRxiv发表预印本，报告用共识引导的泛蛋白质组免疫信息学框架，从尼帕病毒全部九种蛋白序列设计并优先排序出多表位疫苗候选VC033_V6_BD_L03。研究检索901条尼帕病毒蛋白序列，其中842条通过质量过滤，再经聚类、多序列比对和蛋白特异性共识生成处理。 作者将10种表位筛选策略与2种佐剂候选、3种构建架构组合，生成60个疫苗构建体，并优先选择VC033_V6_BD_L03作为先导候选。作者称该构建体的预测人群覆盖率全球为99.78%、南亚为99.96%；C-ImmSim预测其可诱导协调的体液和细胞免疫应答，密码子优化后得到1539 bp表达序列，可虚拟克隆入pET-28a(+)。上述覆盖率和免疫应答均为计算预测，尚未经实验验证。

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