Baker团队发布从头设计糖蛋白预印本
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Baker团队发布从头设计糖蛋白预印本
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AI 综述
华盛顿大学David Baker与Neil King团队在bioRxiv发布预印本,提出用全原子计算流程从头设计糖蛋白,让氨基酸序列同时编码N-连接糖链的位置与组成,并靠设计结构中的空间位阻调控糖链加工。该结果尚未经同行评审。 在126个成功检测的设计中,97个PNGS占据率超过5%,平均94%为复合型糖链;在51个检测到的ΔRASA过滤集中,20/43个设计超过25%寡甘露糖含量,团队称高甘露糖型设计成功率由第一代的1.0%(1/97)升至46.5%(20/51)。在CHO细胞中生产的四个寡甘露糖型糖蛋白,糖链组成与Exp293F细胞中观察到的相当。 在T24人膀胱上皮细胞感染模型中,设计物O2、O3和O4相比负对照分别将UPEC黏附降低50%、56%和75%。
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最新进展11月7日 22:45
Baker团队在bioRxiv报告从头设计可编程N-糖基化蛋白报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月7日
- AI-Protein DesignBaker团队在bioRxiv报告从头设计可编程N-糖基化蛋白
David Baker与Neil P. King团队在bioRxiv发布预印本,提出通过从头蛋白质设计编程N-糖基化位点与聚糖组成。流程整合RFdiffusionAA、LigandMPNN、RF3/AF3与ΔRASA空间包埋指标,使高甘露糖型糖蛋白设计成功率从第一代的1.0%(1/97)提升至46.5%(20/51)。
10月14日
- AI蛋白质精选Baker与Neil King团队从头设计糖蛋白,用氨基酸序列编码N-糖基化位置与组成
华盛顿大学David Baker与Neil King团队开发全原子计算流程,从头设计糖蛋白,使氨基酸序列同时编码N-连接糖链的位置与组成,通过设计三维结构中的空间位阻调控糖链加工。
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