RSMBind:RNA语言模型预测小分子结合位点
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RSMBind:RNA语言模型预测小分子结合位点
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AI 综述
Sharma, N. 等作者提出 RSMBind,一个基于图注意力的深度学习框架,在核苷酸水平预测 RNA 小分子结合位点,融合局部三维环境几何描述符与预训练 RNA 语言模型嵌入。模型在 TR60 和 HARIBOSS 数据集上开发,在 RB9、TE18、TL12、JL10 四个独立基准上评测。 作者报告,RSMBind 在四个基准中的三个取得对比方法中最高的 MCC,较此前最佳结果在 RB9、TL12、JL10 上分别提升 17.1%、7.2%、16.0%,在 TE18 上表现相当。作者还称,仅使用预训练 RNA 语言模型嵌入时模型仍保留预测能力,可用于缺乏明确三级结构特征的情形;结构分析显示,环区相关结合位点通常比茎区内的位点更容易被识别。
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最新进展11月11日 08:00
RSMBind:融合RNA语言模型与结构几何预测RNA小分子结合位点报道时间线
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11月11日
- bioRxiv · Bioinformatics精选RSMBind:融合RNA语言模型与结构几何预测RNA小分子结合位点
作者提出RSMBind,一个基于图注意力的深度学习框架,用于在核苷酸水平预测RNA小分子结合位点,融合局部三维环境几何描述符与预训练RNA语言模型嵌入。模型在TR60和HARIBOSS数据集上开发,在RB9、TE18、TL12和JL10四个独立基准上评测,其中三个基准的MCC为对比方法最高,较此前最佳结果分别提升17.1%、7.2%和16.0%,在TE18上表现相当。
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