靶向侧链MCMC提升apo结构对接位姿恢复
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靶向侧链MCMC提升apo结构对接位姿恢复
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AI 综述
Subramani 与 Shekhar 评估了一种靶向侧链 MCMC 对接方案：该方案结合局部与较大幅度侧链扭转提议，并在谐波主链约束下周期性进行分子动力学弛豫，从 apo 结构生成受体构象集合。 研究以 OpenBind 2A 蛋白酶基准的 859 个实验复合物为测试对象，将上述集合与 apo 受体本身、以及受约束和无约束 MD 生成的集合进行比较。作者报告该方案提升了位姿恢复。 作者同时说明，所报告的改善衡量的是在已生成位姿和受体范围内的最佳情况位姿覆盖；能否推广到前瞻性位姿排序和虚拟筛选，仍有待验证。
AI 根据报道生成 · 7 天前更新
最新进展11月1日 08:00
靶向侧链MCMC采样提升apo结构分子对接位姿恢复报道时间线
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11月1日
- bioRxiv · Bioinformatics精选靶向侧链MCMC采样提升apo结构分子对接位姿恢复
研究评估了一种靶向马尔可夫链蒙特卡洛（MCMC）协议，结合局部与较大幅度侧链扭转提议及周期性MD弛豫，从apo结构生成受体构象集合。
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