模拟揭示DBO对OXA-48变体效力差异
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模拟揭示DBO对OXA-48变体效力差异
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AI 综述
Wang, D.等作者在bioRxiv发表预印本,用QM/MM MD等多尺度模拟研究二氮杂双环辛烷(DBO)类抑制剂对OXA-48变体的抑制差异。结果显示,nacubactam对OXA-48类酶共价抑制的能垒始终高于avibactam,差异源于活性位点电场的DBO特异性变化;作者称,将共价反应速率与非共价结合亲和力的计算预测结合,可准确复现实验IC50值的相对顺序,并据此预测了对新发现的OXA-48变体OXA-517的效力。 研究先确定DBO酰化的第二步为限速步骤,再据此展开模拟。上述效力排序与预测均来自计算模拟,尚未见实验验证。
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最新进展11月6日 08:00
多尺度模拟揭示活性位点静电如何影响DBO对OXA-48变体的抑制效力报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月6日
- bioRxiv · Biochemistry精选多尺度模拟揭示活性位点静电如何影响DBO对OXA-48变体的抑制效力
研究用QM/MM MD等多尺度模拟分析二氮杂双环辛烷(DBO)类抑制剂对OXA-48变体的抑制差异,发现nacubactam对OXA-48类酶共价抑制的能垒始终高于avibactam,差异源于活性位点电场的DBO特异性变化。
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