3DRISM水合预测精度与SuperWater相当
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3DRISM水合预测精度与SuperWater相当
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AI 综述
Swanson等人系统评测了三维参考相互作用位点模型(3DRISM)的蛋白质水合位点预测,在SuperWater的训练集、测试集,以及独立构建的3139个训练域外蛋白结构查询集上,3DRISM的预测精度与SuperWater相当。 研究还称,在随机选取的20个蛋白上,3DRISM与显式溶剂分子动力学模拟结果对比,能准确再现多种局部蛋白环境中的平衡溶剂密度分布;以周质结合蛋白SiaP为例,3DRISM预测的溶剂密度直接捕捉到突变导致的埋藏配体结合口袋内溶剂缺失。上述结论来自预印本,尚未经同行评审。
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最新进展11月2日 15:22
3DRISM水合预测在3139个独立蛋白结构上与SuperWater精度相当报道时间线
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11月2日
- ChemRxiv Preprints精选3DRISM水合预测在3139个独立蛋白结构上与SuperWater精度相当
研究系统评测三维参考相互作用位点模型(3DRISM)的蛋白水合预测,在SuperWater的训练集、测试集及独立构建的3139个训练域外蛋白结构查询集上,其水合位点预测精度与SuperWater相当。
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