Prompteina:用自然语言生成蛋白结构
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Prompteina:用自然语言生成蛋白结构
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AI 综述
华盛顿大学等机构的研究团队提出 Prompteina,让设计者用自然语言描述蛋白质的整体形状、局部结构和结合界面,模型据此同时生成蛋白质的全原子结构与氨基酸序列。团队构建了含约 180 万个蛋白结构条目和 5240 万条文字描述的 Prompteina-Data,并在 Complexa 基础上加入全局与残基级文本条件通路。 在 20 个靶标上,模型对“界面包含多少残基”的文字要求表现出很强的数量控制,论文报告相关系数 ρ>0.99。评估使用 ipSAEmin,这是对预测结合界面可信度的计算评分,分数越高表示对预测界面越有把握,并不等于实验中一定结合。 团队让智能体围绕 GM2A 迭代设计 1000 个骨架,选出 90 个进入实验,其中 89 个成功表达并接受表面等离子共振(SPR)测定,报道称 9 个设计结合 GM2A。论文同时指出,这尚不能证明这些蛋白具有治疗效果,也不能把单靶标的实验命中率推广到其他靶标。
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最新进展11月2日 09:00
Prompteina 用自然语言设计蛋白质:89 个受测设计中 9 个结合 GM2A报道时间线
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11月2日
- AI药物设计实验室精选Prompteina 用自然语言设计蛋白质:89 个受测设计中 9 个结合 GM2A
华盛顿大学等机构提出 Prompteina,以自然语言描述整体形状、局部结构和结合界面,联合生成蛋白质全原子结构与序列。团队构建 Prompteina-Data,含约 180 万个蛋白结构条目和 5240 万条文字描述,基于 Complexa 加入全局与残基级文本条件通路。
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