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ADCNet评测集审计:标签反映开发阶段而非效力

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AI 综述

Odibo等人在ChemRxiv发布预印本,审计ADCNet公开的50个构建体评测集与435个构建体建模集,结论是评测标签更多反映构建体的开发阶段,而非其效力。审计发现,50个评测构建体中33个(66%)不含训练集未见组分,40个(80%)与训练构建体共享载荷-连接子组合,10个(20%)共享完全相同的抗体-载荷-连接子三联体、仅DAR不同;50个评测构建体是435个建模构建体的子集。 作者称,用385个训练构建体拟合的参照预测器在评测集上对 antigen identity 和 linker identity 分别达到0.778和0.773,多数类基线为0.680,而完整模型报告为0.8712。作者还称标签对活性阈值近乎不变。这些是预印本中的审计说法,尚待同行评议。

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11月12日
  1. ChemRxiv Preprints精选
    ADCNet抗体偶联药物评测集数据审计:标签反映开发阶段而非效力

    作者审计ADCNet公开的50个构建体评测集与435个构建体建模集,发现50个评测构建体中33个(66%)不含训练集未见组分,40个(80%)与训练构建体共享载荷-连接子组合,10个(20%)共享完全相同的抗体-载荷-连接子三联体、仅DAR不同。

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