OpenBind拟五年建50万蛋白-配体复合物数据集
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牛津大学教授、OpenBind项目联合负责人Charlotte Deane在《Nature Reviews Drug Discovery》访谈中称,AI在小分子药物发现中尚未复制AlphaFold的成功,瓶颈已从模型转向数量充足、分布合理且同时包含结构与结合强度的数据。OpenBind计划五年内生成超过50万个经实验验证的蛋白质—配体复合物结构,约为现有公开数据规模的20倍。 已公开的首批数据包含来自699种化合物的925个晶体学结合事件,其中601种化合物有配套解离常数测量;首批聚焦肠道病毒A71的2A蛋白酶,以高度相近的柯萨奇病毒A16 2A蛋白酶作为实验替代系统。Deane同时指出,晶体结构只是结合体系的一种观测结果,不等同于细胞内完整状态。 资金方面,Deane称项目第一阶段由英国政府800万英镑拨款启动,盖茨基金会另提供287万美元用于提升数据生成平台通量;初步计划在未来2—3年内将公开的结构—亲和力配对数据规模提升1—2倍。
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