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OpenBind拟五年建50万蛋白-配体复合物数据集

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AI 综述

牛津大学教授、OpenBind项目联合负责人Charlotte Deane在《Nature Reviews Drug Discovery》访谈中称,AI在小分子药物发现中尚未复制AlphaFold的成功,瓶颈已从模型转向数量充足、分布合理且同时包含结构与结合强度的数据。OpenBind计划五年内生成超过50万个经实验验证的蛋白质—配体复合物结构,约为现有公开数据规模的20倍。 已公开的首批数据包含来自699种化合物的925个晶体学结合事件,其中601种化合物有配套解离常数测量;首批聚焦肠道病毒A71的2A蛋白酶,以高度相近的柯萨奇病毒A16 2A蛋白酶作为实验替代系统。Deane同时指出,晶体结构只是结合体系的一种观测结果,不等同于细胞内完整状态。 资金方面,Deane称项目第一阶段由英国政府800万英镑拨款启动,盖茨基金会另提供287万美元用于提升数据生成平台通量;初步计划在未来2—3年内将公开的结构—亲和力配对数据规模提升1—2倍。

AI 根据报道生成 · 2 天前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

11月7日
  1. 智药邦精选
    Nature Reviews Drug Discovery 访谈 OpenBind 负责人 Charlotte Deane:AI 药物发现的数据鸿沟如何填补

    牛津大学 Charlotte Deane 在 Nature Reviews Drug Discovery 访谈中介绍其联合领导的 OpenBind 计划,目标是建成全球最大的开放获取药物-蛋白质相互作用数据集,以改进蛋白-小分子结合结构与亲和力预测。

10月24日
  1. DrugAI
    Nature Reviews Drug Discovery对话OpenBind:以50万复合物结构填补AI药物发现数据缺口

    《Nature Reviews Drug Discovery》对话栏目采访牛津大学Charlotte Deane,讨论AI为何尚未在小分子药物发现中复制AlphaFold的成功,核心判断是瓶颈已从模型转向数量充足、分布合理且同时含结构与结合强度的数据。

10月22日
  1. 智药邦精选
    Nature Reviews Drug Discovery对话OpenBind:以开放蛋白质-小分子数据填补AI药物发现缺口

    《Nature Reviews Drug Discovery》发表科学记者Asher Mullard对牛津大学教授、OpenBind项目联合负责人Charlotte Deane的访谈,讨论AI为何尚未在小分子药物发现中复制AlphaFold的成功,核心判断是瓶颈已从模型转向数量充足、分布合理且同时包含结构与结合强度的数据。

10月17日
  1. DrugIntel
    OpenBind 联合负责人 Charlotte Deane:AI 药物发现缺的是数据而非模型

    牛津大学结构生物信息学家、OpenBind 联合负责人 Charlotte Deane 在 Nature Reviews Drug Discovery 专访中表示,AI 药物发现的瓶颈在于数据而非模型,应重点收集能提升模型性能的数据。

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