侯廷军团队发布PartiDesign统一生成框架
先了解这件事
浙江大学侯廷军团队发布PartiDesign，将结构与序列或化学身份放在同一次Flow Matching生成中协同设计，覆盖蛋白、DNA、RNA、小分子及环肽，并称其扩展了La-Proteina的部分隐变量框架。团队称，在ProtDBench普通MPNN单序列协议下，其估算合格候选产出约为RFD3的4.9倍，加入α螺旋引导后约7.6倍；在AME原子级催化基序骨架搭建中，常规与α引导配置分别约为RFD3的8.6倍和12倍。 上述“合格”仅指通过指定计算筛选，尚不代表实验结合或催化活性；GPU日产出为4090-48G上的标准化模型计时估算，未含预处理、精修等完整流程开销。固定六序列评估中，BoltzGen的三类肽骨架通过率均更高，复杂交联实例仍需更大规模验证；抗体设计已纳入支持范围，但论文尚缺专门的抗体benchmark。 论文称，模型在多数基准上取得所评估方法中最高的估算成功设计产出；代码已开源，并提供无需编程即可使用的在线服务器。
AI 根据报道生成 · 2 天前更新
报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
- 澪乃ゆいPartiDesign：面向实用全类型生物分子设计的结构-序列协同设计范式
澪乃ゆい在 X 上分享了一篇 bioRxiv 预印本，题为 PartiDesign: A structure-sequence co-design paradigm for practical all-to-all biomolecules design，链接为 https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.11.03.763860v1。该帖仅给出标题与链接，未披露具体方法、实验设置或结果数据。
- 澪乃ゆいPartiDesign 发布：统一框架同时生成生物分子三维结构与序列
PartiDesign 被开发为同时设计结构与序列的生物分子设计模型，可在同一框架中处理蛋白质、RNA、DNA 和低分子。该模型支持指定结合部位、二级结构和化学键等条件，并同时生成三维结构以及序列与化学组成。作者称来源见回复，未在正文给出评测结果。
- bioRxiv · BioinformaticsPartiDesign：面向全类型生物分子设计的结构-序列协同设计模型
浙江大学侯廷军团队提出 PartiDesign，一个将 La-Proteina 部分隐变量框架扩展到蛋白质、核酸和小分子的结构-序列协同设计模型，可联合生成分子结构及其序列或化学身份。
- BioTender精选BioTender盘点19个全原子蛋白设计项目：竞赛焦点从生成结构转向控制功能
BioTender 汇总2026年9—10月收录的19个全原子建模与设计项目，覆盖结构生成、复合物预测、结构编码与设计优化，认为竞赛焦点正从生成结构延伸到控制功能。
- 药化猩球侯廷军团队推出PartiDesign：统一生成框架覆盖蛋白与环肽设计
侯廷军团队推出可控生成框架PartiDesign，将结构与序列或化学身份在同一次Flow Matching生成中协同，支持蛋白、DNA、RNA和小分子及环肽设计。
- LeapFun精选侯廷军团队推出PartiDesign：统一生成框架用于蛋白与环肽设计
侯廷军团队推出可控生成框架PartiDesign，将结构与序列或化学身份在同一次Flow Matching生成中协同，覆盖蛋白、DNA、RNA和小分子。在ProtDBench普通MPNN单序列协议下，其估算合格候选产出约为RFD3的4.9倍，加入α螺旋引导后约7.6倍；AME原子级催化基序骨架搭建中常规与α引导配置分别约为RFD3的8.6倍和12倍。
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