DEL-Flow生成靶向MDM2的大环肽并验证活性

研究团队开发了口袋条件化的生成框架DEL-Flow，用于设计靶向MDM2-p53相互作用的大环肽抑制剂。该方法将两代DEL筛选信号与计算构象、大环拓扑结合训练，以SE(3)等变流匹配模型生成全原子坐标，并用MASK去噪模块预测可编辑区域的原子类型、手性和键连接。 以模板126和319为起点，DEL-Flow各生成20个候选，共40个。其中126-18和319-18经DNA外合成后，在荧光偏振实验中抑制MDM2-p53相互作用，IC50分别为1.95和6.50 μM，Ki分别为163和548 nM。 作者称，这些结果支持利用DEL筛选信号和口袋几何引导生成原始库中不存在、且能抑制MDM2-p53相互作用的大环肽。相关结果以预印本形式发布。

AI 根据报道生成 · 4 天前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。