BioMeme预印本：记忆法预测细胞剂量响应

英国STFC、南安普顿大学、西北工业大学等团队在bioRxiv发布预印本，提出“生物响应记忆”方法BioMeme：利用待测药在目标细胞的低剂量实测状态、同细胞中响应相似化合物的数据及参考细胞系中同一化合物的响应，预测下一档剂量下的形态或基因表达谱，以替代学习式状态到响应层。 作者称，在三组筛选的全部九项预注册比较中，记忆对响应方向的预测均优于被替代的学习器；迁移具有化合物特异性，误差降低21.2%，错误化合物至多1.8%，并在预留的MCF7数据中复现；使用20个参考时，单CPU线程拟合仅需数秒，至少比神经调参与拟合快420倍。 后续报道指出，改用独立孔数据评分后，迁移不再显著降低MSE，方向误差反而上升；九组方向误差均有改善，但MSE仅三组支持记忆、五组不显著、一组支持MLP。现有证据限于公共筛选数据的相邻剂量任务，遗传扰动、长期动态、患者来源细胞和前瞻性实验尚待验证。上述结果均来自预印本，尚未经同行评审证实。

AI 根据报道生成 · 2 天前更新