CytoBridge从空间转录组重建虚拟细胞动态

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   bioRxiv · Bioinformatics

   CytoBridge：从离散空间转录组数据重建时空单细胞相互作用的虚拟动力学

   CytoBridge 是一种从离散空间转录组数据重建连续虚拟细胞动力学的方法，通过非平衡平均场薛定谔桥学习细胞状态、位置和种群规模的随机轨迹，并将细胞间相互作用作为动力学驱动因素。在覆盖三种空间转录组平台、跨发育、再生和神经退行的五个数据集上，该方法能准确生成未测量时间点的组织动态，并追踪配体-受体信号。研究还支持用于生成假设的计算机扰动，但仅为计算预测。

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