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BLOOM预印本:转录组虚拟胚胎建模框架

1 篇报道1 个报道来源13 天前更新

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AI 综述

Liang, Z. 等作者在 bioRxiv 发布预印本,提出 BLOOM——一个整合时间群体上下文与发育、调控先验的条件流匹配框架,可在查询阶段按时间正反两个方向生成细胞表达分布。作者称,在覆盖产前发育、视觉皮层成熟和多器官内皮特化的三个小鼠单细胞图谱上,BLOOM 与 22 个时序预测基线比较,在三套数据集的基因与细胞表达相关性上均排名第一。 作者还称,在未测量的阶段,插值与自回归的历史、未来推演可把模拟的表达动态延伸到实测时间点之间及之外;基于输入的基因扰动可进一步探测被编辑基因及相关分子程序随时间的预测响应。上述效果均为预印本作者自述,尚未经同行评审。

AI 根据报道生成 · 12 天前更新

报道时间线

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10月27日
  1. bioRxiv · Bioinformatics精选
    BLOOM:面向转录组虚拟胚胎建模的生物先验流匹配框架

    作者提出BLOOM,一个整合时间群体上下文与发育、调控先验的条件流匹配框架,可在查询阶段按时间正反两个方向生成细胞表达分布。在覆盖产前发育、视觉皮层成熟和多器官内皮特化的三个小鼠单细胞图谱上,BLOOM与22个时序预测基线比较,在三套数据集的基因与细胞表达相关性上均排名第一。

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