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PertVI解耦单细胞扰动响应建模

1 篇报道1 个报道来源4 天前更新

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AI 综述

Wang, Y.等作者提出深度生成模型 PertVI,用于把基线分裂期、细胞状态和批次效应与处理诱导的变化分开,并将异常响应隔离到正交的异常空间。 作者称,在模拟基准测试中,PertVI 能准确解耦相互耦合的生物学轴并恢复微弱的处理信号;在原代人类 CD8+ 和 CD4+ T 细胞的化学与遗传条件筛选中,它区分了记忆前体佐剂与毒性表型模拟,并把标准流程中混在一起、难以分辨的共聚类调控因子解析为有方向性的动力学轨迹和双相反弹。上述效果均为作者报告的结果。

AI 根据报道生成 · 3 天前更新

报道时间线

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11月10日
  1. bioRxiv · Bioinformatics精选
    PertVI:跨动态细胞状态解耦单细胞扰动响应的生成模型

    作者提出深度生成模型 PertVI,将基线分裂期、细胞状态和批次效应与处理诱导的变化分离,并把异常响应隔离到正交的异常空间。

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