CellNet开放2.31亿张跨物种转录组图像

湖南大学曾湘祥团队联合厦门大学、电子科技大学等提出CellNet，用DNA表示基因身份、将基因表达组织成图像并按图像块聚合，同时开放覆盖40个物种、约2.31亿张图像的Image Atlas，配套基因词表、测量掩码与已拟合映射。据该团队介绍，主体预训练使用8张A800，耗时约两周。 团队报告了多项测试结果：在人类肾脏和肺的独立图谱中采用供体隔离测试，考察稀有细胞识别；在TotalX免疫细胞与发育脑数据中，冻结的CellNet在所设编码基因补全测试中预测相关性优于四个比较模型；在小鼠脑Xenium数据中同时隐藏20个目标基因、不输入空间坐标，恢复了Slc17a7、Gad1、Aqp4、Mog等标志基因的空间表达模式。这些均为研究方自述的测试表现。

AI 根据报道生成 · 3 天前更新