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胶质瘤单细胞药物响应方向一致性再分析

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AI 综述

Lavrenteva 等作者重新分析公开的胶质瘤切片培养单细胞 RNA 测序数据(391,444 个细胞,筛出 252,106 个转化胶质瘤细胞),在 19 个 TissueID 单元的 43 组给药-对照比较中检验 AC、OPC、NPC、MES 样状态的药物响应方向一致性。作者称,响应方向一致性(C)是可重复的信号:在高置信状态过滤(r=0.931)、独立选取的 500 基因空间(r=0.634)、已发表的 Neftel 模块(r=0.783)和不重叠基因交叉拟合(r=0.809)下均保持,且在 43 组比较中的 41 组超过两个零模型,在 19 个生物学单元上 19/19 为正(P=3.8e-6)。 状态分离变化(K)则不同:仅在特征空间固定时稳定,特征空间一变即失去一致性,仅约半数比较能与零模型区分。 结论是恶性胶质瘤各状态的药物响应方向基本一致,而状态间分离程度的变化对分析所用的特征空间敏感。

AI 根据报道生成 · 4 天前更新

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11月4日
  1. bioRxiv · Bioinformatics精选
    研究重析胶质瘤切片单细胞数据:恶性胶质瘤各状态药物响应方向基本一致

    研究重析公开的胶质瘤切片培养单细胞RNA测序数据(391,444个细胞,筛出252,106个转化胶质瘤细胞),在19个TissueID单元的43组给药-对照比较中检验AC、OPC、NPC、MES样状态的响应方向一致性。

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