作者发布TfR1靶向VHH从头设计全流程教程
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作者发布TfR1靶向VHH从头设计全流程教程
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AI 综述
药化猩球作者PyFlow发布了一套靶向人源转铁蛋白受体1(TfR1)的VHH纳米抗体从头设计流水线教程及可复现代码,基于华盛顿大学IPD与NVIDIA的RFD4-Proteina流匹配生成模型搭建。 该流程以Tyr211附近区域为核心靶点,保留框架区已知结构、从头设计全部三个CDR,批量生成500条设计,再按pLDDT、界面接触数、表位距离、CDR组氨酸数等指标加权筛出Top 20。作者称代码在Ubuntu 22.04、RTX 5080、CUDA 12.8环境下测试通过;跳过重折叠评估需AF3环境。 上述筛选结果与测试环境均为作者自述,教程未报告湿实验验证。
AI 根据报道生成 · 11 天前更新
最新进展10月29日 09:44
基于 RFD4-Proteina 的 TfR1 靶向 VHH 设计全流程报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月29日
- 药化猩球精选基于 RFD4-Proteina 的 TfR1 靶向 VHH 设计全流程
作者记录了用华盛顿大学 IPD 与 NVIDIA 的 RFD4-Proteina 流匹配模型搭建 TfR1 靶向 VHH 从头设计流水线的完整流程,保留框架区、从头设计三个 CDR,批量生成 500 条设计并按 pLDDT、界面接触数、表位距离、CDR 组氨酸数等加权筛出 Top 20。
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