FGFR1耐药突变模拟未检出结合能变化
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FGFR1耐药突变模拟未检出结合能变化
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AI 综述
He Jia 等人在 ChemRxiv 发布预印本,用分子动力学模拟比较 erdafitinib 与 FGFR1 激酶域的结合,涉及野生型、V561M 耐药突变和 N546K 分子刹车突变,每种各 3 次重复,共 9 条全原子轨迹、4.491 μs。MM/GBSA 与 MM/PBSA 两种终点方法均未检出突变相关的结合自由能变化(GB ANOVA p=0.27,PB p=0.054),作者据此称已排除约 5 kcal·mol-1 量级的结合能惩罚。 作者表示,观察到的突变体与野生型 ΔΔG 低于该重复数下的检出限,也落在终点法的固有不确定度内;由此提出“亲和力不变而动力学速率改变”的推论,并称可用 SPR/BLI 与解离计算检验。该结论来自预印本模拟,尚未经实验验证。
AI 根据报道生成 · 14 天前更新
最新进展10月26日 12:38
FGFR1–erdafitinib耐药突变研究:门控与分子刹车突变在无明显结合能损失下的动态缺陷报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月26日
- ChemRxiv PreprintsFGFR1–erdafitinib耐药突变研究:门控与分子刹车突变在无明显结合能损失下的动态缺陷
研究用9条全原子分子动力学轨迹(野生型、V561M与分子刹车突变N546K各3次重复,共4.491 μs)比较erdafitinib结合激酶域,MM/GBSA与MM/PBSA均未检出突变相关的结合自由能变化(GB ANOVA p=0.27,PB p=0.054),排除了约5 kcal·mol-1量级的惩罚。
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