REVEAL仅凭序列捕捉RNA激发态构象
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REVEAL仅凭序列捕捉RNA激发态构象
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AI 综述
作者提出 REVEAL 工作流，将生成式二级结构采样、trRosettaRNA2 二级结构条件三级结构预测、无偏分子动力学与马尔可夫状态建模耦合。仅用工程化 HIV-1 TAR 突变体序列，在 34 个种子共 6.8 秒聚合无偏采样中捕捉到 ES2 与 GS 的可逆转换，并判定 ES2 为主导态。 作者称，从该突变体 NMR 集合出发的分子动力学即使聚合模拟时间更长仍困在 ES2；AlphaFold3、Boltz-2、ESMFold2、OpenFold3 和 Protenix-v2 等仅序列集合预测器将所有结构置于基态附近，颠倒了实验观测的布居顺序。
AI 根据报道生成 · 1 天前更新
最新进展11月11日 08:00
REVEAL 工作流仅凭序列捕捉 HIV-1 TAR 突变体的 RNA 激发态报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
11月11日
- bioRxiv · Biophysics精选REVEAL 工作流仅凭序列捕捉 HIV-1 TAR 突变体的 RNA 激发态
作者提出 REVEAL 工作流，将生成式二级结构采样、trRosettaRNA2 二级结构条件三级结构预测、无偏分子动力学与马尔可夫状态建模耦合，仅用工程化 HIV-1 TAR 突变体序列，在 34 个种子共 6.8 秒聚合无偏采样中捕捉到 ES2 与 GS 的可逆转换，并正确判定 ES2 为主导态。
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12:0018:0011月13日06:0012:0018:00
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