AlphaFold 3通用预测TCR抗原特异性

Lawson J. Woods等研究人员提出AF3-PTI-PAE方法：用AlphaFold 3预测MHC–抗原肽–TCR三元复合物结构，再以TCR–抗原肽界面的预测排列误差判别抗原特异性，无需针对特定抗原训练。 在独立验证数据集中，该方法对MHC I类和II类限制性抗原的预测AUC中位数分别为0.92和0.81，并能识别此前缺乏结构信息的抗原表位；作为对照，基于MHC多聚体或四聚体染色的配对数据AUC中位数仅为0.61和0.52。 但该方法仍有明显局限：在MHC II类验证集中，特异性为100%、99%和95%时，敏感性中位数分别只有13%、26%和52%；AF3也不能准确预测所有真实结合的TCR复合物，对天然TCR常见的中低亲和力相互作用检出敏感性不足。

AI 根据报道生成 · 6 天前更新