转录组框架推断头颈鳞癌通路依赖性

Afshar与Goli发布预印本，提出用转录组数据推断头颈鳞癌（HNSCC）通路依赖性的框架。模型基于953株GDSC细胞系的50个MSigDB Hallmark活性谱，并按通路汇总药物响应，训练9个Elastic Net模型；交叉验证R²从0.17（IGF1R）到0.48（P53）。在训练中未观察到药物响应的通路上，留一通路验证仍保持排序一致性（Spearman ρ=0.19–0.56）。 作者称，共依赖特征存在一个主导的全局轴（PC1解释62.3%方差，Cronbach's α=0.91），并在不同队列间可重复（Tucker一致性=0.996），但该轴在很大程度上反映CD8+ T细胞浸润（ρ=0.80）。作者同时指出，该特征不具备预后价值。

AI 根据报道生成 · 9 天前更新