RPI-Zero发布零样本RNA-蛋白互作预测模型与基准
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RPI-Zero发布零样本RNA-蛋白互作预测模型与基准
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AI 综述
Eren, K.等作者发布预印本，提出零样本RNA-蛋白质互作预测模型RPI-Zero，并构建含210万样本的严格基准。模型仅用序列、不使用结构信息，可联合读取最长4096 token的全长蛋白与RNA，并用共享motif原型描述蛋白以覆盖未见蛋白；作者称一个模型即可覆盖所有蛋白和RNA类别，且无需已知互作。 基准由四个公共数据库中209个蛋白的1160万CLIP峰构建；序列相似性簇整体划入训练、验证和测试集，另设未见RNA、未见蛋白和未见互作对三个切片，负样本在长度及结合该转录本的其他蛋白数量上与正样本匹配。 上述性能与覆盖范围来自作者预印本的自述，尚未经同行评审证实。
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最新进展11月5日 08:00
RPI-Zero：零样本RNA-蛋白质互作预测模型与严格基准报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
11月5日
- bioRxiv · Bioinformatics精选RPI-Zero：零样本RNA-蛋白质互作预测模型与严格基准
作者提出RPI-Zero，一个仅用序列、可联合读取全长蛋白与RNA（最长4096 token）的零样本RNA-蛋白质互作预测模型，并用共享motif原型描述蛋白以覆盖未见蛋白。
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