Pev:跨家族蛋白突变策略预印本
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Pev:跨家族蛋白突变策略预印本
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AI 综述
Yibo Wen、Han Liu 发布预印本,提出通用突变策略 Pev:它从跨蛋白家族的实验数据中学习,在单次并行查询中决定下一步突变或停止,无需针对目标家族拟合模型权重。作者称,一套策略即可覆盖肽、小型折叠结构域和抗体,兼顾结合与稳定性目标。 在留出家族的十孔筛选实验中,Pev 找到的有益突变数量为随机选择的 3.3 倍、为零样本 ESM-2 的 1.8 倍;在留出的 GB1 景观闭环搜索中,它优于用目标测量重新拟合的岭回归替代模型。作者还称,事后校准可改善概率可靠性而不改变决策;在每次请求 1000 个候选时,共享编码的吞吐量超过逐突变编码的 800 倍。上述效果均为预印本作者报告,尚未经同行评审。
AI 根据报道生成 · 4 天前更新
最新进展11月5日 13:00
Pev:跨蛋白家族的单次并行查询突变选择策略报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月5日
- arXiv · q-bio.QM (定量方法)精选Pev:跨蛋白家族的单次并行查询突变选择策略
作者提出Pev,一种从跨家族实验数据学习、在单次并行查询中决定下一步突变或停止的通用突变策略,无需针对目标家族拟合模型权重。在留出家族的十孔筛选实验中,Pev找到的有益突变数量为随机选择的3.3倍、为零样本ESM-2的1.8倍,并在留出的GB1景观闭环搜索中优于用目标测量重新拟合的岭回归替代模型。
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