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ChemRxiv Preprints· Brown, Emmanuel·· 5 天前精选AI 评分65

研究:数据受限下隐蔽口袋预测中结构信息贡献有限,语言模型信号占主导

The Limited Contribution of Structural Information Relative to Language-Model Signal in Data-Limited Cryptic Pocket Prediction

AI 导读

该预印本在固定PocketMiner原小规模分子动力学训练集与架构的条件下,比较仅几何、仅ESM2嵌入与两者融合三种变体对隐蔽口袋预测的影响。仅几何基线测试ROC-AUC为0.498,仅ESM2为0.817,融合为0.835,后两者置信区间统计上不可区分;在CryptoBench上基线0.494、融合0.716,置信区间不重叠,分层分析中各口袋形成机制下结论一致。

推荐理由

在固定小规模训练集与架构的条件下,比较几何信息与ESM2信号对隐蔽口袋预测的贡献,为数据受限场景提供参照。

来源:ChemRxiv Preprints · chemrxiv.org