Briefings in Bioinformatics· Xiaochuan Yang, Zaiduo Li, Zhijuan Li, Wei Zhang, Xianyu Zhang, Tiansong Yang, Mingliang Liu, Xiaokun Li·· 2 天前精选AI 评分60
CRAFT：在理化约束下条件化从头设计抗原特异性TCR的生成模型
CRAFT: an antigen-specific TCR generative model for conditional de novo design with physicochemical constraints
AI 导读
【摘要级】研究提出CRAFT，一个以pMHC为条件、在理化约束下从头设计抗原特异性TCR CDR3β序列的解耦生成模型。模型由捕获pMHC上下文的抗原编码器PrimeBERT与保留天然受体先验的自回归解码器PrimeTCR组成，两者通过交叉注意力耦合，并加入Atchley因子嵌入以在解码中引入界面理化约束。
推荐理由
该模型把pMHC上下文与界面理化约束纳入TCR CDR3β序列生成，为抗原特异性TCR设计提供可参考的建模思路。
来源：Briefings in Bioinformatics · doi.org