ChemRxiv Preprints· Halbwedl, Niklas·· 19 天前精选AI 评分72
DeImmu-MPNN:在从头蛋白质设计中降低免疫原性
DeImmu-MPNN: Reducing Immunogenicity in De Novo Protein Design
AI 导读
作者用直接偏好优化微调 ProteinMPNN,得到 DeImmu-MPNN,在六个 HLA-DRB1 等位基因上把 NetMHCIIpan 预测的 MHC II 类呈递相对基线模型降低 41.4%,降至长度匹配人蛋白水平,同一批设计上 NetMHCpan 预测的 MHC I 类呈递降低 33.0%,代价是序列回复率下降 2.1 个百分点且未检出结构损失。
推荐理由
研究用偏好优化改造 ProteinMPNN,在保持序列回复率与结构的前提下降低预测的 MHC 呈递,为治疗性蛋白设计提供可迁移思路。
来源:ChemRxiv Preprints · chemrxiv.org