bioRxiv · Bioinformatics· Ling, K., Zhang, Y., Zhang, Z., Nakamura, T., Kihara, D. ·· 22 天前精选AI 评分60
Distance-AF Multimer：用用户自定义距离约束改进蛋白复合物结构建模
Distance-AF Multimer: A Multi-Step Approach for Protein Complex Structure Modeling with User-Defined Distance Constraints
AI 导读
作者提出 Distance-AF Multimer，用用户提供的残基对距离信息引导并修正 AlphaFold-Multimer 的对接预测，以两步流程从多个初始构象迭代优化以满足距离约束。在涵盖不同链数和对接误差的蛋白复合物基准上，该方法表现与其他深度学习结构预测方法相当或更优，并展示了在含 5 条以上链的大型多链组装体上的潜力。该工作为预印本摘要，结果基于文中基准评测。
推荐理由
该方法把用户提供的残基对距离约束接入 AlphaFold-Multimer，为实验距离数据与预测结构不一致的复合物建模提供可复用思路。
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