研究用生成式AI按定制二级结构基序与缩减氨基酸字母表设计多肽

【摘要级】研究开发并评估了一个生成式AI蛋白质设计模型，用RCSB PDB中数十万个蛋白质训练，针对缩减氨基酸字母表（RAA）设计具有定制二级结构基序的新蛋白质。摘要报告在多种氨基酸字母表和设计复杂度下总体成功，且对相当一部分设计，仅用物理化学序列空间与二级结构信息训练的模型，ESMFold预测的折叠接近目标结构。该工作为生物技术、天体生物学与早期地球演化生物学等多领域提供设计基础。